好文推薦 | 安捷倫發(fā)布二代測(cè)序全流程質(zhì)控白皮書



文庫(kù)制備過程中最重要的 QC 步驟之一發(fā)生在 NGS 工作流程開始之前。這一關(guān)鍵 QC 步驟就是分析要使用的起始材料,無(wú)論是 DNA 還是 RNA。確保高質(zhì)量的起始材料是制備高質(zhì)量文庫(kù)并獲得成功測(cè)序結(jié)果的第一步。大多數(shù) NGS 文庫(kù)制備試劑盒建議使用特定的起始濃度和起始量,以獲得最佳測(cè)序結(jié)果。如果起始材料降解或質(zhì)量較差,可能會(huì)難以甚至無(wú)法利用樣品創(chuàng)建文庫(kù)。一些研究考察了樣品質(zhì)量和下游分析之間的相關(guān)性。
整個(gè) NGS 文庫(kù)制備過程的質(zhì)量控制

確定了用于 NGS 文庫(kù)制備的合適樣品后,需采取多個(gè)步驟將其轉(zhuǎn)變?yōu)橛糜跍y(cè)序的合適文庫(kù)。為了獲得良好可靠的測(cè)序數(shù)據(jù),強(qiáng)烈建議在工作流程中多個(gè)環(huán)節(jié)設(shè)置 QC 檢查點(diǎn),以確保創(chuàng)建高質(zhì)量文庫(kù)。檢查點(diǎn)中包括片段化和接頭連接后的樣品 QC。



安捷倫自動(dòng)化電泳產(chǎn)品系列提供了多種用于核酸 QC 分析的儀器,包括生物分析儀系統(tǒng)、片段分析儀系統(tǒng)、TapeStation 系統(tǒng)和 Femto Pulse 系統(tǒng)。自動(dòng)化電泳儀非常適合在整個(gè) NGS 文庫(kù)制備過程中測(cè)定樣品的分子量大小、濃度和摩爾濃度,已在科學(xué)文獻(xiàn)中廣為引用。
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